Новосибирск. 10 февраля. ИНТЕРФАКС-СИБИРЬ - Учение Института цитологии и генетики (ИЦиГ, Новосибирск) разработали две технологии, помогающие создавать новые сорта растений, сообщает издание СО РАН "Наука в Сибири".
Отмечается, что одной из задач института и центра коллективного пользования "Биоинформатика" является создание растений с заданными свойствами. Ученым удалось создать программы, автоматизирующие анализ фенотипа, то есть проявившихся признаков.
"В рамках нашей работы мы секвенируем геномы, но не только у одного сорта растений, а сразу у нескольких ближайших родственников. Это делается для того, чтобы получить возможность на основе сравнения геномных последовательностей популяций оценить вариабельность генома, определить, какие мутации присутствуют и как они ассоциированы с различными важными признаками", - приводятся в сообщении слова заведующего лабораторией эволюционной биоинформатики и теоретической генетики ИЦиГ Дмитрия Афонникова.
"Сегодня нами развиваются методы, основанные на анализе двумерных и трехмерных изображений при помощи вычислительных компьютерных технологий", - отметил он.
В результате ученые создали мобильное приложение, которое, анализируя фотографию, распознает характеристики (форму, длину, ширину и площадь) зерен из одного колоса и считает их.
"Вторая технология кроме перечисленных параметров также сможет определить урожайность колоса, но для этого зёрна не нужно будет даже отделять от стебля. Сейчас мы занимаемся глубоким машинным обучением - чтобы алгоритмы заработали, необходимо огромное количество обучающих данных, которые мы храним на серверах ЦКП", - рассказал Афонников.
"Я надеюсь, что внедрение наших технологий сделает их массовыми, позволит существенно экономить временные затраты и устранит необходимость участия квалифицированных специалистов в подобной рутиной работе", - отметил ученый.
